Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UPK3BQ9BT76 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UPK3BQ9BT76 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms