Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRACR2AQ9BSW2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRACR2AQ9BSW2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms