Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms