Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MXRA8Q9BRK3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MXRA8Q9BRK3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MXRA8Q9BRK3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MXRA8Q9BRK3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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