Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C20orf78Q9BR46 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms