Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYD88Q99836 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms