Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX2Q99697 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX2Q99697 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms