Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD9AQ99638 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD9AQ99638 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD9AQ99638 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms