Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL13Q99616 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms