Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3CQ99613 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms