Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCLRE1CQ96SD1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DCLRE1CQ96SD1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms