Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ALS2Q96Q42 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms