Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CR12Q96Q35 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms