Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP4Q96PP9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP4Q96PP9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms