Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRELID3AQ96N28 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRELID3AQ96N28 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms