Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF488Q96MN9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF488Q96MN9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms