Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE3Q96MG7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE3Q96MG7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms