Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPD52L3Q96J77 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms