Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TVP23CQ96ET8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms