Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC10A4Q96EP9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC10A4Q96EP9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms