Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB2Q96DC9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUB2Q96DC9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms