Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NSUN4Q96CB9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSUN4Q96CB9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms