Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ULK4Q96C45 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms