Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYTL4Q96C24 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms