Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHD2Q96C19 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms