Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDAQ92838 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDAQ92838 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDAQ92838 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDAQ92838 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDAQ92838 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDAQ92838 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDAQ92838 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EDAQ92838 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDAQ92838 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDAQ92838 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDAQ92838 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDAQ92838 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDAQ92838 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDAQ92838 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDAQ92838 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDAQ92838 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDAQ92838 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDAQ92838 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDAQ92838 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDAQ92838 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDAQ92838 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDAQ92838 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDAQ92838 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDAQ92838 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDAQ92838 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms