Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRUQ92729 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRUQ92729 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms