Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCG3Q8WXD2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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