Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HAVCR2Q8TDQ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HAVCR2Q8TDQ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms