Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PATJQ8NI35 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATJQ8NI35 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms