Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PJA1Q8NG27 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PJA1Q8NG27 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms