Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYRIPQ8NFW9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms