Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMG8Q8ND04 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG8Q8ND04 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG8Q8ND04 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms