Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms