Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC191Q8NCU4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC191Q8NCU4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms