Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DTX3Q8N9I9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DTX3Q8N9I9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms