Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ANKRD42Q8N9B4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD42Q8N9B4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms