Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MSL3Q8N5Y2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms