Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHCHD4Q8N4Q1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHCHD4Q8N4Q1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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