Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3V7

SYNPO, Synaptopodin, humanhuman

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Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPOQ8N3V7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNPOQ8N3V7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNPOQ8N3V7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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