Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D3Q8IZS8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D3Q8IZS8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms