Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLD3Q8IV08 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLD3Q8IV08 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms