Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALYREFQ86V81 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALYREFQ86V81 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms