Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00523Q86TU6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00523Q86TU6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms