Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTU1Q7Z7A3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTU1Q7Z7A3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms