Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT25Q7Z3Z0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT25Q7Z3Z0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms