Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP2Q7RTS6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP2Q7RTS6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms