Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTOP1Q7RTM1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTOP1Q7RTM1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms