Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC129Q6ZRS4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC129Q6ZRS4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms