Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCBE1Q6UXH8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms